Το μεταπτυχιακό στην Ηλεκτρονική Μάθηση (MSc) του Τμήματος Ψηφιακών Συστημάτων στοχεύει στην ανάπτυξη όλων των απαραίτητων ψηφιακών ικανοτήτων για νέους απόφοιτους ΑΕΙ και επαγγελματίες της εκπαίδευσης, ώστε να μπορούν να ανταποκριθούν στο διαρκώς εξελισσόμενο πεδίο της Ψηφιακής Εκπαίδευσης.
Το μεταπτυχιακό στην Ηλεκτρονική Μάθηση (MSc) είναι το παλαιότερο μεταπτυχιακό πρόγραμμα στο αντικείμενο αυτό στην Ελλάδα, λειτουργεί από το 2004, εξελίσσεται διαρκώς κάθε χρόνο, έχει περισσότερους από 500 απόφοιτους με 100% απορρόφηση στο αντικείμενο σπουδών και σημαντικό ποσοστό σε ηγετικές θέσεις και συνδέεται άμεσα με την αγορά εργασίας.